上海市農業(yè)科學院是市屬的綜合性農業(yè)科研機構，成立于1960年。下設作物林果研究所、設施園藝研究所、食用菌研究所、生態(tài)環(huán)境保護研究所、畜牧獸醫(yī)研究所、生物技術研究所、農產品質量標準與檢測技術研究所、農業(yè)科技信息研究所、數(shù)字農業(yè)工程與技術研究所、農業(yè)生物基因中心等10個研究機構， 擁有10個和部級科技創(chuàng)新平臺和成果轉化平臺，4個市級科技平臺。
全院現(xiàn)有在職職工1000余名，其中專業(yè)技術人員515人，高級專業(yè)技術職務科技人員190名，碩、博士305名，享受特殊津貼專家69名。形成了種質創(chuàng)新和遺傳改良、設施園藝技術、生態(tài)農業(yè)技術、農業(yè)生物與標準化、農產品保鮮加工、高新技術農業(yè)應用、都市農業(yè)理論等優(yōu)勢學科（領域）。與30多個國家或地區(qū)開展科技交流和合作研究。編輯出版《上海農業(yè)學報》和《食用菌》等7種學術類、技術類刊物，重點培育生物疫苗、食（藥）用菌、種子種苗三大科技產業(yè)，科技服務立足上海、輻射長三角，服務全國。
“十五”以來，上海市農業(yè)科學院緊緊圍繞上海建設高效生態(tài)現(xiàn)代農業(yè)的目標，堅持自主創(chuàng)新，加強學科、平臺、基地和隊伍建設，不斷提升科技創(chuàng)新能力、成果轉化應用能力和自我發(fā)展能力。全院共承擔國家、部（市）級以上科研攻關項目443項，獲得部（市）級以上科技成果獎62項，其中，國家科技進步二等獎1項，市科技進步一等獎7項，235個農作物新品種通過審（認）定。
展望未來，上海市農業(yè)科學院將牢牢把握加快推進農業(yè)科技自主創(chuàng)新與成果轉化應用這兩大基本任務，圍繞著上海經(jīng)濟的健康發(fā)展與社會的和諧進步，以科技支撐并上海未來農業(yè)的發(fā)展。